利用计算方法在大型化合物库中快速发现可能活性的候选分子,支持命中物发现与先导优化。可按结构基 VS(基于受体)与配体基 VS(基于已知活性分子)组合实施,兼顾效率、准确性与化学多样性。
样品要求
受体结构(PDB/模型)与口袋信息;或至少1–5个已知活性配体/片段
筛选库来源与规模(商业库/REAL 虚拟库/自建库),是否需要去重与并购样对照
约束条件:必需相互作用、理化窗口、给药途径(口服/CNS 等)
期望产出规模与时间
服务周期
1–5 个工作日(≤100 万分子;更大规模按量并行计算与排期)
常见问答
没有蛋白结构能否做 VS?
可以,采用配体基策略(相似性/药效团/QSAR),并可结合同源模建或 AlphaFold 结构进行结构基补充。
命中率大概多少?
取决于靶点可成药性与先验信息,典型 1–10%;融合多策略与严格过滤通常更稳健。
需要购买多少化合物验证?
常见 20–200 个,建议覆盖高分与多样性代表,并保留阳性/阴性对照。
如何保证"新颖性"?
可设定与已知化合物的 Tanimoto 阈值并做系列去重,同时标注可专利空间的结构要点(不构成法律意见)。