限制性蛋白水解串联质谱(LiP-MS)

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技术服务详情

限制性蛋白水解在天然条件下切割蛋白质表面暴露的柔性区域,药物结合会改变蛋白质构象和溶剂可及性,导致特定肽段的酶解模式发生变化。通过定量蛋白质组学比较药物处理和对照样品的肽段丰度,可鉴定药物结合靶标并定位结合位点。



样品要求
细胞样品(≥10^8细胞)或组织样品(≥500 mg)

  • 药物化合物与工作浓度

  • 实验设计(处理条件、对照组)

  • 可选:蛋白质结构信息(PDB)


服务周期

15-28个工作日(取决于样本数量和分析深度)


常见问答


LiP-MS与DARTS有何区别?

LiP-MS提供肽段水平的分辨率,可精确定位结合位点和构象变化区域;DARTS只能鉴定靶蛋白,无法定位结合位点。LiP-MS信息更丰富但成本更高。


LiP-MS可以定位到具体的氨基酸残基吗?

LiP-MS可定位到肽段水平(通常5-20个氨基酸),结合蛋白质结构信息可进一步缩小到结构域或特定区域。


LiP-MS需要已知蛋白质结构吗?

不需要,但有结构信息(实验结构或AlphaFold预测)可大大增强数据解释能力,帮助理解构象变化的结构基础。