基于活性的蛋白质组学(ABPP)

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技术服务详情

ABPP 小分子药物靶点鉴定平台通过化学生物学技术即基于活性蛋白分析(Activity-based Protein Profiling)鉴定到候选靶点,通过简单生信分析筛选出候选靶蛋白。在此基础上,将候选靶蛋白进行纯化或者直接在细胞裂解液水平进行热蛋白质分析(CETSA,cellular thermal shift assay)和药物亲和反应靶标稳定性(DARTS,Drug affinity responsive target stability)进行定性验证靶点与小分子药物的直接互作。接下来通过 SPR/ITC/BLI 定量验证药物-靶点直接互作。最后通过分子动力学模拟结合限制性酶解-质谱分析 LiP-MS(LimitedProteolysis-Mass Spectrometry)在蛋白位点水平解析药物与靶点蛋白互作模式。客户可以订购整套

服务,也可以订购整套服务中的某一个阶段的服务,每一个环节都可以根据客户需求进行制定。


样品要求

细胞样品(≥10^7细胞)或组织样品(≥100 mg)

  • 药物化合物与浓度信息

  • 实验设计(处理条件、对照组)

  • 预期靶标类型(如已知)

  • 可选:已知阳性对照


服务周期

10-21个工作日(取决于样本数量和分析深度)


常见问答


ABPP可以鉴定哪些类型的靶标?

ABPP主要鉴定具有催化活性的酶类靶标,如丝氨酸水解酶、半胱氨酸蛋白酶、金属蛋白酶等。不同探针可覆盖不同酶家族。


ABPP与传统靶标鉴定方法有何优势?

ABPP可在天然细胞环境中直接鉴定活性靶标,无需纯化蛋白,可同时发现多个靶标和脱靶蛋白,特别适合共价抑制剂的靶标发现。


如何验证ABPP鉴定的靶标?

通过Western Blot、酶活性测定、表面等离子共振(SPR)、细胞功能实验等多种方法进行正交验证,确保靶标的真实性和功能相关性。