分子对接

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技术服务详情

分子对接是一类计算方法，用于预测两种分子（常见为小分子配体与蛋白质受体）的结合位点、结合构象与相对亲和力，为先导发现与优化提供可操作的结构依据。



样品要求

受体：目标蛋白PDB结构或结构文件（含必要辅因子/金属）、期望pH与体系说明、已知口袋坐标（如有）

配体：SMILES/SDF/Mol2，标注立体化学；如需考虑多质子化/互变体请说明


服务周期

1-3个工作日（≤100个化合物；更大批次按量排期）


常见问答


无高质量PDB结构怎么办？

可提供结构评估与建模建议，或协助选择AlphaFold结构并进行合理化处理。


如何选择对接口袋？

优先基于共晶配体与功能位点；未知目标可进行口袋预测与盲对接预筛。


对接分数是否等于结合自由能？

打分为相对指标，建议结合对照与二次评估（共识评分/MM/GBSA）与实验数据综合判断。




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